砚台是文房四宝之一，为中医医生临证处方、撰写诊籍和编纂医书的必备工具。由于它质地坚固，能代代相传，故在流传至今的古代文房四宝中砚最为多见。上海中医药博物馆馆藏2方名医用砚为:清代名医吴尚先用砚和陈莲舫用砚，分别刻有“潜玉老人著理瀹骈文之砚”和“莲舫先生校勘素灵之砚”，可知此两方砚台是这两位名医著书治学所用之砚。
吴尚先著《理瀹骈文》用砚
清同治七年(1868)。石质。
砚长17cm，宽12.5cm，高2.5cm。是砚为清代名医吴尚先著《理瀹骈文》所用之砚，砚背左侧刻有篆文两行共11字：“潜玉老人著理瀹骈文之砚”及行书8字“戊辰(1868)十月陈遇安镌”。
吴尚先（约1806～1886），字师机，原名安业，晚年亦署杖仙，别号潜玉居士。钱塘（今属浙江杭州）人。吴尚先善用外治法治疗内外诸疾，尤以按穴位辨证施用膏药薄贴见长。积数十年之经验，著《外治医说》，后取《子华子》（此书系后人伪托）“医者理也，药者瀹也”之意，易名《理瀹骈文》。是书中详细论述了中医外治法的理论根据和具体治疗措施，是中医学中独具一格的著作。
陈莲舫校勘《素灵》用砚
清光绪十一年（1885）。端石石质。
砚长16cm，宽10.8cm，高2.9cm。长方形。是砚为晚清医家陈莲舫著书治学所用之砚，系端砚之精品。砚盖左刻篆书10字“莲舫先生校勘素灵之砚”，楷书小款有“光绪乙酉（1885）初秋伯其题赠”等语。
陈莲舫（1840～1914），名秉钧，又号乐余老人，别署庸叟。江苏青浦（今属上海）人，出身世医之家。精通内、外各科，擅治疑难杂症，以审病详慎、用药轻灵著称。弟子达上百人，1912年创设上海医会。光绪二十四年至三十四年（1898～1908），先后五次奉召进京为光绪帝和慈禧太后诊病获显效，乃敕封为三品刑部荣禄大夫，充御医值御药方事。门人董韵笙所辑《陈莲舫医案秘钞》可窥其医术端倪。著有《女科秘诀大全》《医学启悟》等书。